Les pangolins n'y étaient pour rien

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Sujet : Les pangolins n'y étaient pour rien
De : paul.aubrin (at) *nospam* invalid.org (Paul Aubrin)
Groupes : fr.bio.medecine
Date : 09. Nov 2023, 10:59:19
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Organisation : Eweka Internet Services
Message-ID : <Ib13N.3897$D%n3.941@fx01.ams4>
User-Agent : Mozilla Thunderbird
L'accusation reposait sur de multiples erreurs.
https://pubpeer.com/publications/3FB983CC74C0A93394568A373167CE#1
<extrait traduit>
Les principaux résultats sont gonflés par une erreur dans le code.
Les auteurs estiment que les lignées SARS-CoV-2 "A" et "B" sont le résultat d'au moins deux événements distincts de transmission inter-espèces à l'homme. Cette conclusion est basée sur les facteurs de Bayes calculés dans le carnet Jupyter cladeAnalysis.ipynb. Ce carnet présente un bogue dans la fonction clade_analysis_updated. La ré-exécution de l'analyse principale sans le bogue réduit les facteurs de Bayes d'un facteur de six. Cela réduit considérablement la confiance dans les résultats des auteurs.
Les analyses de sensibilité devraient être réexécutées sans le bogue (ce qui n'est pas faisable sans les données, qui n'ont pas été publiées).
Il y a d'autres lacunes. En particulier, les différentes hypothèses sont testées par rapport à des preuves différentes (plus précisément, par rapport à des conditions différentes dérivées des preuves), de sorte que les facteurs de Bayes sont fortement biaisés en faveur de l'hypothèse des retombées multiples. Cette question sera abordée dans un commentaire séparé.
<fin de l'extrait>

Date Sujet#  Auteur
9 Nov 23 o Les pangolins n'y étaient pour rien1Paul Aubrin

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